Компоненты системы Secret Net используют следующие структуры централизованного хранения данных:
• база данных сервера безопасности на сервере СУБД — содержит централизованные журналы и оперативную информацию для мониторинга системы;
• база данных доменных служб Active Directory или AD LDS/ADAM — содержит параметры системы Secret Net, относящиеся к компьютерам, пользователям и группам пользователей, списки серверов безопасности, списки электронных идентификаторов и других объектов для централизованного управления системой защиты.

Разделение хранилищ обусловлено спецификой обращения к данным. Обращения осуществляют только те компоненты, которым это разрешено. Контроль и разграничение доступа к хранилищам осуществляются самой системой, поэтому от администратора не требуется дополнительных действий для обеспечения защиты обращений.